- Grand Séminaire de Bujumbura
- Université Espoir d’Afrique (UEA)
- Université Lumière de Bujumbura (ULBU)
- Université du Lac Tanganyika (ULT)
- Université des Grands Lacs (UGL)
- Université de Mwaro (UM)
- Université Martin Luther King (UMLK)
- Université de Ngozi (UNGo)
- Université Paix et Réconciliation (UPR) Ø
- Université Sagesse d’Afrique (USA)
- Université des Collines Ø
- Université Ntare Rugamba (UNR) Ø
- International Leardership University (ILU – Bu)
- Université Polytechnique de Gitega
- Bujumbura International University
- East Africa Star University de Rugombo
- Université Chrétienne de Bujumbura
- Université Polytechnique Intégrée de Cibitoke **
- International University of Equador
- Université REMA de Ruyigi **
Instituts Privés
- Institut Supérieur des Techniques de Gestion (ISTG)
- Institut Supérieur de Contrôle de Gestion (ISCG) *
- INITELEMATIQUE
- Institut Supérieur des Technologies (IST)
- Institut Supérieur de Management (ISM)
- Institut Supérieur d’Enseignement Technique (ISET)
- Institut Supérieur de Gestion et d’Informatique (ISGI)
- Institut International Libre d’Afrique (INILAQUE) Ø
- Institut Supérieur de Développement (ISD)
- Institut Universitaire des Sciences de la Santé et du Développement Communautaire (IUSSDC)
- Institut Africain de Gestion des Risques Economiques et de Développement International (IAGREDI)
- Ecole Supérieure des Sciences de la Santé de Kinindo
- Institut Supérieur Paramédical de Gitega
- Institut Supérieur d’Entrepreunariat du Burundi
- Institut Supérieur d’Entrepreneuriat et de Gestion de Kanyosha (ISEG)
- East African Leardership Institute « EALI » de Muyinga
- Institut Supérieur de Gestion de Muzinda
- SUMMIT International Institute
- Institut Universitaire des Sciences de la Santé et du Développement (INUSSAD)
- Institut Supérieur Islamique de Muyinga (ISIM)
- Livingtone University College
- Institut Universitaire des Lacs de Kirundo
- Institut du Ministère Evangélique de Nouvelle Vision du Christ (MENVC) **
Notification
- soit ne fonctionnent plus *, ou n’ont jamais fonctionné ** (ISCG*, Université REMA de Ruyigi**, et Institut du MENVIC**, UPI-Cibitoke**)
- ont été empêchés d’enrôler des étudiants en 1ère année Ø (UNR, INILAQE et, récemment, UPR et Université des Collines)